Il Direttore generale del DIS è il diretto referente del Presidente del Consiglio dei ministri e dell’Autorità delegata per l'esecuzione delle loro attribuzioni in materia di informazione per la sicurezza.

È nominato dal Presidente del Consiglio dei ministri, sentito il CISR.

Il suo incarico ha la durata di 4 anni ed è rinnovabile per una sola volta.

Al Direttore generale del DIS, responsabile della direzione degli uffici del Dipartimento, compete tra l’altro: 

• assicurare il coordinamento e il raccordo informativo nei casi in cui AISE e AISI operino al di fuori della loro competenza territoriale

• proporre l’attribuzione della qualifica di ufficiale o di agente di pubblica sicurezza ad appartenenti di DIS, AISE e AISI nei casi previsti dalla legge
• autorizzare, su proposta dei Direttori di AISE o AISI, personale delle Agenzie l' uso di documenti di copertura o l'esercizio di attività economiche simulate

• richiedere al Presidente del Consiglio dei ministri l'avvio di inchieste interne

Il Direttore generale del DIS svolge le funzioni di segretario del CISR, partecipa al Collegio di vertice e presiede il Consiglio d'amministrazione.